蜂蜜是一种高糖的物质，很多人担心吃蜂蜜会诱发龋齿。
但是近期研究表明蜂蜜诱发龋齿的概率远远低于蔗糖。目前公认的龋齿的发病原因主要包括细菌，口腔环境，宿主（包括寄生虫、病毒等微生物）和时间这四个因素。其基本原理是致龋性食物糖，特别是蔗糖、白糖和糖浆等精制糖紧紧贴附于牙面，形成一层膜，在适宜的温度下，细菌繁殖产生菌斑，菌斑深层产酸，侵蚀牙齿，使牙齿脱矿，进一步损坏有机质，形成龋洞。
致龋菌主要有产酸菌和革兰氏阳性菌，蜂蜜虽然是一种含糖的物质，但是蜂蜜中的糖主要是葡萄糖和果糖，而且蜂蜜具有抗菌性，实验研究表明蜂蜜对革兰氏阳性菌具有很好的抗性，能够抑制口腔细菌的繁殖，对牙齿起到保护的作用。
电镜研究发现，喝完果汁10分钟之后牙齿表面可以观察到明显的侵蚀现象，但是喝完蜂蜜半小时后依然观察不到侵蚀现象，这说明吃蜂蜜比喝果汁等饮料还安全。
蜂蜜对多种革兰氏阳性和阴性菌具有很好的抗性，这是因为蜂蜜是一种糖的高渗溶液，会导致细菌等微生物失水死亡；其次，蜂蜜含有多种有机酸，是一种酸性溶液，pH在4.0左右，高酸性环境可以抑制微生物的生长。此外，蜂蜜中含有过氧化氢、多酚类、黄酮类等多种抗菌成分。
蜂蜜能够抑制微生物和真菌的生长，其抗菌效果在多篇文献中都有记载。蜂蜜抑制的细菌主是革兰氏阳性菌。蜂蜜也对多种致病菌株具有抑制作用。试管实验研究表明，蜂蜜具有抑制风疹病毒和刺球绦虫生长发育的作用。
蜂蜜的抗菌作用归因于多种作用的结果，主要是因为其低水分活度能够抑制细菌的生长；蜂蜜中的葡萄糖氧化酶能产生具有氧化作用、抗菌功能的过氧化氢；蜂蜜中也含有一些非过氧化氢类抗菌性物质，例如芳香酸、酚酸和黄酮类物质等。另一方面，蜂蜜溶液具有较低的pH值，这对于它的抗菌活性具有积极的作用。
相对于非过氧化氢类物质稳定的抗菌活性，过氧化氢由于在热、光的作用下能够被破坏，抗菌活性就会受到不同程度的损害。因此，加热、光照等因素对于蜂蜜的抗菌活性有很大的影响。考虑到以上因素，一般情况下蜂蜜都要求储藏在阴凉的地方。
所以，总体来说，吃蜂蜜对牙齿是安全的。
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